手术前
接受手术前，医生会为病人眼睛作详细检查，假如病人有配戴隐形眼镜，需在验眼前暂停配戴，软性隐形眼镜需暂停1星期，而硬镜则需暂停3星期。
验眼过程会比配眼镜更详细，包括量度眼睛屈光度数、最佳视力、角膜弧度、形状及厚度，并会以显微镜检查眼睛及眼球外部。亦会以眼药水放大瞳孔以检查病人的视网膜。放大瞳孔後眼睛会轻微畏光，看近物时会变得模糊，检查後便会回复正常。
手术
手术前，病人的眼睛首先要经清洗消毒、然後滴麻醉药作局部麻醉。之後，病人会平躺在手术床上，医生会用眼撑(eyelid speculum)把眼睛撑开。手术过程中，病人会处於清醒状态，并需要凝望著一个目标灯号，
角膜薄片切割有两种方式：
微型角膜切割器：以微型角膜切割器切割角膜，角膜切割器设有机械齿轮，以刀片自动切割出角膜瓣层。
IntraLase无刀切割：以激光在角膜切割，造成角膜瓣层。切割後需等待约20至30分钟，让角膜内气泡吸收，才可进行手术。
切割出角膜瓣後，医生会把角膜瓣翻开，并开始射出-{激光}-，病人眼睛需要望著灯号，-{激光}-开始把角膜组织削去，以改变其弧度。病人会听到声响及嗅到烧焦的气味，每只眼的激光切削过程约1至2分钟。完成切削後，医生会把角膜瓣放回原位、把眼撑除去，让眼睛合上，伤口无需缝针。
医生会再次为病人滴眼药水，然後以眼罩保护眼睛，经过一段时间的休息病人便可回家，无需住院。刚完成手术後，病人的视力已可见改善，但暂时会较为模糊，亦可能有轻微不适。
手术後
为避免角膜瓣移位，手术後须暂时配戴眼镜或眼罩保护眼球，更不可揉眼。手术後隔天需回到医生处覆诊。
